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Progetto di esame

 
Immagine Gianluca Della Vedova
Progetto di esame
di Gianluca Della Vedova - venerdì, 5 maggio 2017, 14:46
 

Il progetto viene discusso su appuntamento con i docenti.

Il progetto può essere fatto anche in gruppi, composti al massimo da 3 persone.

Modulo Analisi sequenze


Partendo dai trascritti del gene TTN che ha codice Ensembl ENSG00000155657, si vuole:
1.  calcolare il numero di trascritti
2.  calcolare il numero di esoni per ogni trascritto
3.  determinare le regioni genomiche (esone o porzione di esone) che sono presenti in tutti i trascritti.

Il GTF della regione genomica che contiene il gene è allegato.

Progetto modulo 'Systems Biology'

Integrare il Particle Swarm Optimizer con il simulatore deterministico ed applicarlo ad un modello per ricostruire il valore incognito di una costante di reazione. Si chiede, inoltre, di valutare la capacità dell'algoritmo di ottimizzazione nella ricostruzione di ciascuna costente di reazione mantenendo fisse le altre.

Il testo completo è allegato