Course Syllabus
Obiettivi
Il corso
si prefigge di fornire allo studente gli strumenti necessari per la corretta
richiesta delle indagini di laboratorio biochimico-cliniche, genetiche, microbiologiche
ed anatomopatologiche e per l’interpretazione critica dei risultati, sia come
probabilità di malattia che di gravità e del significato fisiopatologico,
clinico e prognostico.
Contenuti sintetici
BIOCHIMICA CLINICA e BIOLOGIA MOLECOLARE CLINICA: Il laboratorio in oncologia e reumatologia. Valutazione degli stati infiammatori. Casi clinici di medicina di laboratorio. MICROBIOLOGIA CLINICA 1: Accertamenti diagnostici relativi alle infezioni respiratorie, del sistema nervoso centrale, dell’apparato gastroenterico, dell’apparato genito-urinario. Infezioni in gravidanza. Del feto, del neonato e dell’infanzia, infezioni sistemiche, cardiache, delle ossa, delle articolazioni e della cute, infezioni opportuniste e nosocomiali. Metodologie e tecniche diagnostiche dirette ed indirette nella batteriologia, virologia, micologia e parassitologia. Valutazione della sensibilità in vitro dei microorganismi ai farmaci antimicrobici. Discussione di casi clinici.
METODOLOGIE E TECNICHE IN ANATOMIA PATOLOGICA 1: Stadiazione tumorale. Tipologia di campioni, indicazioni alle richieste di esame. Metodi e finalità dell’autopsia. Introduzione a principi e metodi della diagnostica istopatologia. Interpretazione al referto anatomopatologico. Oltre la morfologia: immunocitochimica e patologia molecolare
GENETICA MEDICA. Indicazioni cliniche al test genetico a fini diagnostici, prognostici e di indirizzo terapeutico. Significato di test genetico, e legislazione italiana dedicata. Screening genetici riproduttivi, diagnosi prenatale per trisomia 21. Tecnologie per l’individuazione di patologie geniche e applicazioni diagnostiche in citogenetica e Biologia molecolare. I biomarker genetici utilizzati in oncologia in ambito prognostico, farmacodinamico e predittivo. Utilizzo di modelli statistici Bayesiani predittivi. Uso delle banche dati specifiche per i tests genetici.Programma esteso
- Il Laboratorio Clinico. Principi di organizzazione. Informatizzazione e consulenza.
- Modalità di richiesta per l’effettuazione di analisi di laboratorio
- Concetti generali sui controlli di qualità. Rilevanza del controllo di qualità nelle diverse branche della medicina di laboratorio
- Tecniche per il prelievo e la raccolta dei materiali biologici da sottoporre ad analisi biochimico clinica, microbiologica, e genetica.
Esami del sangue e dei fluidi corporei: urine, liquor cerebrospinale, sinoviale, pleurico, pericardico, peritoneale ed amniotico: prelievo e/o raccolta, esame fisico, esame chimico, esame microscopico, esame microbiologico, test raccomandati e principali correlazioni cliniche.
- Misure di autoprotezione per minimizzare il rischio biologico e chimico nella raccolta e gestione dei materiali da sottoporre ad analisi di laboratorio.
- Applicazioni della diagnostica molecolare nel laboratorio di Biochimica clinica, Microbiologia Clinica, Anatomia Patologica e Genetica Medica.
Casi clinici di Medicina di laboratorio
BIOCHIMICA CLINICA e BIOLOGIA MOLECOLARE CLINICA Il laboratorio in oncologia e reumatologia.
Valutazione degli stati infiammatori
MICROBIOLOGIA CLINICA 1 Metodologie e Tecniche Diagnostiche Dirette (es. Esame microscopico e colturale) ed Indirette (Sierologia) nella: Batteriologia, Virologia, Micologia e Parassitologia
Valutazione della sensibilità “in vitro” dei microrganismi ai farmaci antimicrobici.
METODOLOGIE e TECNICHE IN ANATOMIA PATOLOGICA 1
Diagnostica istocitopatologica: metodologia e principi della diagnosi morfologica.
Applicazioni della telepatologia
Diagnostica autoptica. Finalità e scopi del riscontro diagnostico. La richiesta di autopsia. Differenze tra autopsia sanitaria e medicolegale
Metodiche ancillari in anatomia patologica. Microscopia elettronica, immunocitochimica, biologia molecolare.
GENETICA MEDICA
Impatto delle malattie genetiche
Fonti biologiche per i test genetici
Citogenetica:
- Tecniche, applicazioni, indicazioni, limiti
- Casi clinici
Citogenetica molecolare: FISH, ARRAY CGH, SNP array
- Tecniche, applicazioni, indicazioni, limiti
- Casi clinici
Genetica Molecolare
- Tecniche, applicazioni, indicazioni, limiti
- Casi clinici
Test genetici in ambito riproduttivo:
- Diagnostica prenatale classica e NIPT
- Test genetici pre-impianto
Appropriatezza prescrittiva dei test genetici, consulenza genetica, classificazione dei test genetici, validità analitica e utilità clinica.
Aspetti etici e sociali dei test genetici.
Test genetici e malattie complesse.
Sindromi da predisposizione ai tumori e interpretazione dei test genetici.
Prerequisiti
Conoscenze
relative ai corsi propedeutici indicati nel regolamento del corso di laurea
Modalità didattica
Lezioni
frontali, Tirocinio
Materiale didattico
McPherson RA, Pincus MR Henry's Clinical Diagnosis
and Management by Laboratory Methods, 23a edizione in lingua inglese. Ed. Elsevier, 2016
Federici G. Medicina
di laboratorio ed McGraw-Hill. IV edizione, 2014
Marshall W, Lapsley M., Day A Clinical chemistry ed
Mosby. 8a edizione in
lingua inglese. Ed. Elsevier, 2016
Microbiologia
Clinica (autori: Mims c., Dockrell HM., Goering RW., Roitt I., Wakelin D.,
Zuckerman M.) EMSI, 2006, III ed.
Microbiologia
Clinica (autore: Cevenini R.) PICCIN.
Kumar V, Abbas A., Aster J.C. Robbins & Cotran Le basi
patologiche delle malattie Ed. Masson, 9th ed., 2015
Mariuzzi, G.M. Anatomia patologica e correlazioni
anatomo-cliniche Ed.Piccin, 1° 2007
AJCC Cancer Staging Manual 8th
ed. Springer, 2017
Robbins e Cotran -
Le basi patologiche delle malattie / V. Kumar et al. Elsevier 2011.
Verrà inoltre distribuito materiale didattico durante le lezioni
Periodo di erogazione dell'insegnamento
Primo semestre
Modalità di verifica del profitto e valutazione
L’esame
viene strutturato in modo da verificare la capacità dello studente di
affrontare dal punto di vista diagnostico alcuni casi clinici, con particolare
enfasi all’analisi delle interconnessioni fra i diversi approcci. La prova
consiste in 31 domande a quiz a scelta multipla, con eventuale colloquio orale
di discussione, a discrezione dei docenti.
Orario di ricevimento
Su appuntamento richiedibile via e-mail
Aims
The goal of the course is to provide the tools for the
correct use of biochemical, microbiological, pathological and genetic tests,
and the definition of their indications and interpretation.
Contents
CLINICAL BIOCHEMISTRY 1 AND CLINICAL PATHOLOGY: Lab test in oncology and rheumatology. Inflammation markers. Discussion of clinical reports.
CLINICAL MICROBIOLOGY. Diagnostics of respiratory, CNS, gastro-enteric, genito-urinary infections. Pregnancy and infant infections. Systemic, cardiac, bone, joint and skin infections. Nosocomial infections. Methodologies and diagnostic techniques to use in microbiology, virology, mycology and parasitology. Antibiogram. Discussion of clinical reports.
PATHOLOGY METHODS AND TECHNIQUES 1. Contribution of thelepathology, immunocytochemistry, electron microscopy, and molecular biology to completion of pathology report. Autopsy pathology: objectives, procedures and report. Death certification.
MEDICAL GENETICS. Indications for diagnostic, prognostic and therapeutic genetic tests. Significance of genetic testing, and related Italian laws. Reproductive Genetic Screening, increased genetic risk for prenatal diagnosis (eg. trisomy 21). Use of technology for the detection of genetic diseases and diagnostic applications in cytogenetics and Molecular biology.
Genetic biomarkers in clinical oncology as prognostic, predictive and pharmacodynamics tool. Application of predictive Bayesian statistical models. Appropriate use of specific databases for genetic testing.Detailed program
Clinical laboratory. Organization principles. Laboratory Informative System.
The correct request of lab tests.
Pre-analytical, analytical and post-analytical variability. Conditions able to affect lab test results.
General rules of Quality assessment and their application in the different sections of lab.
Techniques for the collection of biological fluids/materials to submit to biochemical, microbiological, and genetic tests.
Blood and biological fluid analysis: urines, cerebrospinal fluid, synovial, pleural, pericardic, peritoneal and amniotic fluid collection, analysis.
Auto protection measures.
Application of molecular diagnostics to Clinical Biochemical, Clinical Microbiology, Genetics and Pathology labs.
Case reports of laboratory Medicine
CLINICAL BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY Lab test in oncology and rheumatology.
Inflammation markers.
CLINICAL MICROBIOLOGY 1Direct and indirect techniques in bacteriology, virology, and parasitology.
Evaluation of in vitro sensitivity of microorganisms to antibiotics.
TECHNICAL METHODOLOGY IN PATHOLOGY 1
Histocytopathology: principles and methods of morphological diagnosis.
Applications of telepathology
Autoptic diagnosis. The autopsy request. Differences between medical and legal autopsy.
Immunocytochemistry and molecular biology to completion of pathology report.
MEDICAL GENETICS Relevance and Epidemiology of Genetic Diseases
Genetic tests: which material for which test
Cytogenetics:
- Techniques, applications, indications, limits
- Clinical rounds
Molecular Cytogenetics: FISH, ARRAY CGH, SNP array
- Techniques, applications, indications, limits
- Clinical rounds
Molecular Genetics
- Techniques, applications, indications, limits
- Clinical rounds
Genetic test in the reproductive field:
- Prenatal diagnosis and NIPT
- Pre-implantation tests
Appropriateness of prescription of genetic tests, genetic counseling, validity and utility of genetic tests.
Ethical and social aspects of genetic tests
Genetic tests and complex diseases.
Syndromes of tumor predisposition and interpretation of genetic tests.Prerequisites
Propaedeutic skills
Teaching form
Lectures, traineeship
Textbook and teaching resource
McPherson RA, Pincus MR Henry's Clinical Diagnosis and Management by Laboratory Methods, 23a English edition. Ed. Elsevier, 2016
Federici G. Medicina di laboratorio ed McGraw-Hill. IV ed., 2014
Marshall W, Lapsley M., Day A Clinical chemistry ed Mosby. 8a ed. Ed. Elsevier, 2016
Microbiologia Clinica (autori: Mims c., Dockrell HM., Goering RW., Roitt I., Wakelin D., Zuckerman M.) EMSI, 2006, III ed.
Microbiologia Clinica (autore: Cevenini R.) PICCIN.
Kumar V, Abbas A., Aster J.C. Robbins & Cotran Le basi
patologiche delle malattie Ed. Masson, 9th ed., 2015
AJCC Cancer Staging Manual 8th
ed. Springer, 2017
Mariuzzi, G.M. Anatomia patologica e correlazioni anatomo-cliniche Ed.Piccin, 1° 2007
Robbins e Cotran - Pathologic Basis of Disease/ V. Kumar et al. Elsevier 2014.
Moreover, the teachers will provide educational material.
Semester
First semester
Assessment method
Case report analysis.
Written and oral test. Multiple choice test (31 questions)
Office hours
Visits by appointment that can be requested via e-mail