Course Syllabus
Obiettivi
Fornire allo studente le conoscenze di base della Microbiologia clinica e della Microbiologia sistematica con la presentazione generale dei microrganismi patogeni per l'uomo e delle tecniche diagnostiche da applicare nel Laboratorio di Microbiologia per la diagnosi delle malattie infettive.
Fornire allo studente conoscenze relative agli agenti patogeni e alle modalità di trasmissione delle principali malattie infettive trasmissibili, ai metodi analitici per la diagnosi impiegati nel laboratorio biomedico.
Contenuti sintetici
Classificazione ed identificazione dei batteri, ruolo del microbiologo clinico e concetti di base delle malattie infettive. Studio dei singoli generi e specie di riscontro clinico con applicazione alla pratica di laboratorio.
Sistematica batterica: Cocchi Gram-positivi e Gram-negativi; Bacilli Gram-negativi e Gram-positivi; batteri aerobi ed anaerobi. Raccolta, trasporto e trattamento dei campioni per esami colturali.
Presentazione delle tecniche colturali con scelta dei terreni da utilizzare in base alle caratteristiche dei microrganismi presenti nei diversi materiali clinici, con allestimento delle colture batteriche a temperature e atmosfere specifiche. Tecniche di semina, lettura ed interpretazione critica delle colture con identificazione dei batteri patogeni (identificazioni morfologiche, biochimiche, sierologiche e molecolari), antibiogrammi mirati ed interpretazione degli stessi in relazione ai riferimenti EUCAST.
Diagnosi batteriologica, virologica e micologica in relazione ai diversi materiali biologici con riferimento alle relative malattie infettive.
Controllo di qualità interno CQI e VEQ, valutazione esterna di qualità, nel laboratorio di Microbiologia clinica.
Rischio biologico in laboratorio.
Studio di microrganismi patogeni sia in ambito medico che veterinario con applicazione alla diagnosi di laboratorio.
Definizione e classificazione delle zoonosi; principali zoonosi e loro vie di trasmissione
Ruolo del TLB nella diagnosi delle zoonosi
Programma esteso
- Studio delle caratteristiche generali, fattori di virulenza, manifestazioni cliniche, campioni microbiologici e test diagnostici di singoli generi e specie di riscontro clinico con applicazione alla pratica di laboratorio.
- Sistematica microbica: Cocchi Gram-positivi (stafilococchi, streptococchi, enterococchi) e Gram-negativi (Neisseria); Bacilli Gram-negativi (Enterobacteriaceae, Pseudomonas ed altri); micobatteri; batteri anaerobi. Virus herpetici, virus influenzali, coronavirus, papillomavirus; virus dell'epatite.
- Trattazione dello stato di biofilm
- Epidemiologia, eziologia e iter diagnostico delle infezioni delle alte e delle basse vie respiratorie, delle infezioni delle vie urinarie, delle infezioni a trasmissione sessuale, delle infezioni nel sangue e del sistema nervoso centrale.
Infezioni ospedaliere e tipizzazione molecolare dei patogeni "sentinella".
Screening dei microrganismi "multi-drug-resistant". Cenni sui meccanismi di resistenza agli antibiotici. Test rapidi e non per l'individuazione dei meccanismi di resistenza agli antibiotici.
Test di sensibilità agli antibiotici e criteri di interpretazione (CLSI vs EUCAST). - Diagnosi batteriologica, virologica e micologica in relazione ai diversi materiali biologici con riferimento alle relative malattie infettive.
- Rischio biologico in laboratorio.
- Studio di microrganismi patogeni sia in ambito medico che veterinario con applicazione alla diagnosi di laboratorio.
- Definizione e classificazione delle zoonosi; principali zoonosi e loro vie di trasmissione; ruolo del TLB nella diagnosi delle zoonosi.
- Diagnosi virologica, parassitologica e micologica in relazione ai diversi materiali biologici con riferimento alle zoonosi.
Prerequisiti
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Modalità didattica
Nel periodo di emergenza Covid-19 le lezioni si svolgeranno da remoto asincrono con eventi in videoconferenza sincrona.
Materiale didattico
E. W.Koneman, S.D.Allen, W.M.Janda, Introduzione alla Microbiologia, Antonio Delfino Editore.
SOPs consultabili sul sito della Health Protection Agency, all’indirizzo:
http://www.hpa-standardmethods.org.uk/pdf_sops.asp
AMCLI Percorsi diagnostici
EUCAST www.eucast.org
E.Matassa ZOONOSI E SANITÀ PUBBLICA Springer
A.Mazzeo IL CONTROLLO DELLE PRINCIPALI ZOONOSI E MALATTIE INFETTIVE IN PRODUZIONE PRIMARIA Aracne Editrice
J.R.August, A.S.Loar MALATTIE ZOONOSICHE Antonio Delfino Editore
M.Scaglia, S.Gatti, E.G.Rondanelli PARASSITI E PARASSITOSI UMANE Selecta Medica
V.Puccini, E.Tarsitano PARASSITOLOGIA URBANA Edagricole
M.La Placa PRINCIPI DI MICROBIOLOGIA MEDICA S.E.Esculapio
F.Bernieri, D.Crotti, D.Galli, A.Raglio MANUALE ILLUSTRATO DI DIAGNOSTICA PARASSITOLOGICA Bio-Dev
I.De Carneri PARASSITOLOGIA GENERALE E UMANA Casa Editrice Ambrosiana
Periodo di erogazione dell'insegnamento
Primo semestre
Modalità di verifica del profitto e valutazione
Nel periodo di emergenza Covid-19 gli esami orali saranno solo telematici. Verranno svolti utilizzando la piattaforma WebEx e nella pagina e-learning dell'insegnamento verrà riportato un link pubblico per l'accesso all'esame di possibili spettatori virtuali.
Il voto finale, basato sul punteggio medio ponderato ottenuto dallo studente nelle diverse valutazioni, è fissato al termine del colloquio orale di Microbiologia clinica con lo studente.
Orario di ricevimento
Su appuntamento
Sustainable Development Goals
Aims
To provide basic knowledge and diagnostic techniques of clinical microbiology.
To provide the knowledge of main routes of transmission of zoonotic diseases and of analytical methods for the diagnosis in biomedical and veterinary laboratories.
Contents
Classification and identification of bacteria.
Basic knowledge of infectious diseases.
Gram positive and gram negative bacteria. Aerobe and anaerobe bacteria.
Collection, transportation and treatment of biological samples. Techniques of culture, identification, interpretation.
Diagnosis of bacterial, viral, parasitical, fungal infections.
Antibiograms and their interpretation according to EUCAST.
Quality controls: CQI and VEQ in Clinical Microbiology lab.
The biological risk in Microbiology lab.
Methods for the diagnosis of infectious diseases in the biomedical and veterinary laboratories.
Definition and classification of zoonoses, main diffusion routes.
Role of the laboratory technician in the diagnosis of zoonosis.
Detailed program
- Classification and identification of bacteria.
- Basic knowledge of infectious diseases.
- Gram positive and gram negative bacteria. Aerobe and anaerobe bacteria.
- Antibiograms and their interpretation according to EUCAST.
- Diagnosis of bacterial, viral, parasitical, fungal infections.
- Classification and identification of bacteria.
- Basic knowledge of infectious diseases.
- Gram positive and gram negative bacteria. Aerobe and anaerobe bacteria.
- Collection, transportation and treatment of biological samples.
- Techniques of culture, identification, interpretation.
- Quality controls: CQI and VEQ in Clinical Microbiology lab.
- Alert study, infectious diseases and nosocomial infections.
- The biological risk in Microbiology lab.
- Study of pathogens, in human and veterinary medicine, applied to laboratory diagnosis.
- Definition and classification of zoonoses, main diffusion routes. Role of the laboratory technician in the diagnosis of zoonosis.
- Diagnosis of viral, parasitic or mycotic zoonoses, in relation to different biological samples.
Prerequisites
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Teaching form
During the Covid-19 emergency period, lessons will be held remotely asynchronously with synchronous videoconferencing events
Textbook and teaching resource
E. W.Koneman, S.D.Allen, W.M.Janda, Introduzione alla Microbiologia, Antonio Delfino Ed.
Download SOPs of Health Protection Agency, from website: http://www.hpa-standardmethods.org.uk/pdf_sops.asp
AMCLI Percorsi diagnostici
EUCAST www.eucast.org
E.Matassa ZOONOSI E SANITÀ PUBBLICA Springer
A.Mazzeo IL CONTROLLO DELLE PRINCIPALI ZOONOSI E MALATTIE INFETTIVE IN PRODUZIONE PRIMARIA Aracne Editrice
J.R.August, A.S.Loar MALATTIE ZOONOSICHE Antonio Delfino Editore
M.Scaglia, S.Gatti, E.G.Rondanelli PARASSITI E PARASSITOSI UMANE Selecta Medica
V.Puccini, E.Tarsitano PARASSITOLOGIA URBANA Edagricole
M.La Placa PRINCIPI DI MICROBIOLOGIA MEDICA S.E.Esculapio
F.Bernieri, D.Crotti, D.Galli, A.Raglio MANUALE ILLUSTRATO DI DIAGNOSTICA PARASSITOLOGICA Bio-Dev
I.De Carneri PARASSITOLOGIA GENERALE E UMANA Casa Editrice Ambrosiana
Semester
First semester
Assessment method
During the Covid-19 emergency period, oral exams will only be online. They will be carried out using the WebEx platform and on the e-learning page of the course there will be a public link for access to the examination of possible virtual spectators.
The final mark, based on the weighted average score obtained by the student in the various assessments, is set at the end of the oral interview of Clinical Microbiology with the student.
Office hours
By appointement
