Course Syllabus
Obiettivi
Fornire allo studente le conoscenze di base della Microbiologia clinica e della Microbiologia sistematica con la presentazione generale dei microrganismi e delle tecniche diagnostiche da applicare nel Laboratorio Biomedico per la diagnosi delle malattie infettive.
Fornire allo studente conoscenze relative agli agenti patogeni e alle modalità di trasmissione delle principali malattie infettive e parassitarie trasmissibili all’uomo dagli animali (domestici e no), ai metodi analitici per la diagnosi impiegati nel laboratorio biomedico e veterinario
Contenuti sintetici
Lo studente deve sapere:
- Studio dei singoli generi e specie di riscontro clinico con applicazione alla pratica di laboratorio.
- Sistematica batterica: Principali patogeni microbici quali batteri cocchi Gram-positivi e Gram-negativi, Bacilli Gram-negativi e Gram-positivi; batteri patogeni aerobi ed anaerobi, micobatteri, miceti patogeni.
- Raccolta, conservazione e trattamento dei campioni microbiologici.
- Semina dei campioni microbiologici: esame colturale
- Colorazione vetrini con colorazioni quali Gram, etc.
- Lettura dei vetrini da colonie o da materiale patologico.
- Lettura campioni microbiologici da materiali patologici.
- Tecniche per passaggi di sottocolture, arricchimenti e reisolamenti.
- Letture di identificazioni presuntive con test rapidi e classici e definitive di genere e specie con conferme sierologiche definitive.
- Lettura di antibiogrammi manuali ed automatici ed interpretazione degli stessi in relazione ai riferimenti eucast.
- Cenni di tecniche di caratterizzazione fenotipica e genotipica microbica.
- Biobancaggio microbico.
- Interpretazione degli esami microbiologici.
- Diagnosi batteriologica, virologica e micologica in relazione ai diversi materiali biologici con riferimento alle relative malattie infettive.
- Controlli di qualità: interno cqi ed esterni veq (regione lombardia e neqas – inglese).
- Studio di alert, malattie infettive ed infezioni ospedaliere.
- Rischio biologico in laboratorio.
- Studio di microrganismi patogeni sia in ambito medico che veterinario con applicazione alla diagnosi di laboratorio.
- Definizione e classificazione delle zoonosi; principali zoonosi e loro vie di trasmissione; ruolo del TLB nella diagnosi delle zoonosi.
- Diagnosi virologica, parassitologica e micologica in relazione ai diversi materiali biologici con riferimento alle zoonosi.
Programma esteso
Classificazione ed identificazione dei microbi patogeni, ruolo del microbiologo clinico e concetti di base delle malattie infettive. Studio dei singoli generi e specie di riscontro clinico con applicazione alla pratica di laboratorio.
Sistematica batterica: Cocchi gram positivi e gram negativi; Bacilli gram negativi e gram positivi; batteri aerobi ed anaerobi. Micobatteri. Principali virus di interesse clinico. Raccolta, trasporto e trattamento dei campioni per esami colturali.
Sistematica micotica e parassitologica: principali patogeni fungini e parassiti.
Presentazione delle tecniche colturali con scelta dei terreni da utilizzare in base alle caratteristiche dei microrganismi presenti nei diversi materiali clinici, con allestimento delle colture batteriche a temperature e atmosfere specifiche. Tecniche di semina, lettura ed interpretazione critica delle colture con identificazione dei batteri patogeni (identificazioni morfologiche, biochimiche, sierologiche e molecolari), antibiogrammi mirati ed interpretazione degli stessi in relazione ai riferimenti EUCAST.
Diagnosi batteriologica, virologica e micologica in relazione ai diversi materiali biologici con riferimento alle relative malattie infettive.
Biobancaggio microbico.
Controllo di qualità interno (CQI) e valutazione esterna di qualità (VEQ), nel laboratorio di Microbiologia clinica.
Rischio biologico in laboratorio.
Studio di microrganismi patogeni sia in ambito medico che veterinario con applicazione alla diagnosi di laboratorio.
Definizione e classificazione delle zoonosi; principali zoonosi e loro vie di trasmissione
Ruolo del TLB nella diagnosi delle zoonosi.
Prerequisiti
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Modalità didattica
Lezioni frontali, esercitazioni.
Materiale didattico
Eudes Lanciotti - Microbiologia Clinica - V edizione - CEA Casa Editrice Ambrosiana
E. W.Koneman, S.D.Allen, W.M.Janda, Introduzione alla Microbiologia, Antonio Delfino Editore.
Antonelli, Clementi, Pozzi, Rossolini - Principi di Microbiologia Medica - IV edizione - CEA Casa Editrice Ambrosiana
SOPs consultabili sul sito della Health Protection Agency, all’indirizzo:
http://www.hpa-standardmethods.org.uk/pdf_sops.asp
AMCLI Percorsi diagnostici
EUCAST www.eucast.org
M.Scaglia, S.Gatti, E.G. Rondanelli PARASSITI E PARASSITOSI UMANE Selecta Medica
F.Bernieri, D.Crotti, D.Galli, A.Raglio MANUALE ILLUSTRATO DI DIAGNOSTICA PARASSITOLOGICA Bio-Dev
I.De Carneri PARASSITOLOGIA GENERALE E UMANA Casa Editrice Ambrosiana
Periodo di erogazione dell'insegnamento
Primo semestre
Modalità di verifica del profitto e valutazione
Il voto finale, basato sul punteggio medio ponderale ottenuto dallo studente nelle diverse valutazioni, è fissato al termine del colloquio orale del modulo di Microbiologia Clinica con lo studente.
Orario di ricevimento
Su appuntamento
Sustainable Development Goals
Aims
To provide the student with the basic knowledge of Clinical Microbiology and Systematic Microbiology with the general presentation of microorganisms and diagnostic techniques to be applied in the Biomedical Laboratory for the diagnosis of infectious diseases.
To provide the knowledge of main routes of transmission of zoonotic diseases and of analytical methods for the diagnosis in biomedical and veterinary laboratories.
Contents
Student’s skills:
- Classification and identification of bacteria.
- Basic knowledge of infectious diseases.
- Gram positive and gram negative bacteria. Aerobe and anaerobe bacteria.
- Antibiograms and their interpretation according to EUCAST.
- Diagnosis of bacterial, viral, parasitical, fungal infections.
- Classification and identification of bacteria.
- Basic knowledge of infectious diseases.
- Gram positive and gram negative bacteria. Aerobe and anaerobe bacteria.
- Collection, transportation and treatment of biological samples.
- Techniques of culture, identification, susceptibility testing interpretation.
- Basics of phenotypic and microbial genotypic characterization techniques.
- Microbial biobanking.
- Quality controls: CQI and VEQ in Clinical Microbiology lab.
- Alert study, infectious diseases and nosocomial infections.
- The biological risk in Microbiology lab.
- Study of pathogens, in human and veterinary medicine, applied to laboratory diagnosis.
- Definition and classification of zoonoses, main diffusion routes. Role of the laboratory technician in the diagnosis of zoonosis.
- Diagnosis of viral, parasitic or mycotic zoonoses, in relation to different biological samples.
Detailed program
Classification and identification of bacteria.
Basic knowledge of infectious diseases.
Main Gram-positive and Gram-negative pathogens. Aerobe and anaerobe bacteria. Mycobacteria. Fungal pathogens. Main viral pathogens.
Collection, transportation and treatment of biological samples. Techniques of culture, identification, interpretation.
Diagnosis of bacterial, viral, parasitical, fungal infections.
Antibiograms and their interpretation according to EUCAST.
Quality controls: CQI and VEQ in Clinical Microbiology lab.
Microbial Biobanking.
The biological risk in Microbiology lab.
Methods for the diagnosis of infectious diseases in the biomedical and veterinary laboratories.
Definition and classification of zoonoses, main diffusion routes.
Role of the laboratory technician in the diagnosis of zoonosis.
Prerequisites
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Teaching form
Lectures and exercises
Textbook and teaching resource
Eudes Lanciotti - Microbiologia Clinica - V edizione - CEA Casa Editrice Ambrosiana
E. W.Koneman, S.D.Allen, W.M.Janda, Introduzione alla Microbiologia, Antonio Delfino Editore.
Antonelli, Clementi, Pozzi, Rossolini - Principi di Microbiologia Medica - IV edizione - CEA Casa Editrice Ambrosiana
SOPs consultabili sul sito della Health Protection Agency, all’indirizzo:
http://www.hpa-standardmethods.org.uk/pdf_sops.asp
AMCLI Percorsi diagnostici
EUCAST www.eucast.org
M.Scaglia, S.Gatti, E.G. Rondanelli PARASSITI E PARASSITOSI UMANE Selecta Medica
F.Bernieri, D.Crotti, D.Galli, A.Raglio MANUALE ILLUSTRATO DI DIAGNOSTICA PARASSITOLOGICA Bio-Dev
I.De Carneri PARASSITOLOGIA GENERALE E UMANA Casa Editrice Ambrosiana
Semester
First semester
Assessment method
The final mark, based on the weighted average score obtained by the student in the various assessments, is set at the end of the oral interview of the Clinical Microbiology module with the student.
Office hours
By appointement
