Syllabus del corso

Esporta

Fornire allo studente le conoscenze sulle tecnologie di proteomica applicate a studi clinici

Concetti di proteomica : strumentazioni e approcci analitici utilizzati nello studio del proteoma, delle loro alterazioni per indagini biomediche.

Definizione dei termini e delle caratteristiche delle tecniche analitiche cromatografiche per indagini quali- quantitative. Conoscenze e nozioni della spettrometria di massa applicata alla proteomica. Identificazione di proteine con la tecnica del “Peptide mass fingerprint”. Spettrometria di massa accoppiata (MS/MS). Interpretazione di spettri MS/MS di peptidi. Identificazione delle proteine mediante approcci bottom-up e top-down. Caratterizzazione di modificazioni posttraduzionali mediante spettrometria di massa. Proteomica quantitativa: gel-free e gel-based; label-based e label-free. Tecniche di “imaging” mediante spettrometria di massa e sue applicazioni: profiling e Imaging . Esempi di applicazioni in ricerche cliniche.

Conoscenze di base di chimica, biochimica e statistica

Lezioni frontali; Esercitazioni

Le lezioni/esercitazioni si svolgeranno in presenza fisica.

Review e articoli pubblicati su riviste internazionali verranno indicati durante il corso. Downard K., Mass spectrometry . A foundation course. Royal Society of Chemistry, 2004 ISBN 0-8504-609-7 Gary Siuzdak, Mass Spectrometry for Biotechnology, Academic Press 1996 Per consultazione: J. H. Gross, Mass Spectrometry. A Textbook, Berlin – Heidelberg, Springer Verlag, 2004 E. De Hoffmann, V. Stroobant, Mass Spectrometry. Principles and Application, 2nd Edition Chichester, John Wiley & Sons, 2001. C. Dass, Principles and Practice of Biological Mass Spectrometry, New York, Wiley-Interscience, 2000. ISBN 0471330531 Chapman, John R. Mass Spectrometry of Proteins and Peptides, Humana press 2000, ISBN 0- 89603-609-X Walker, John M. The Proteomics Protocols Handbook Humana Press, 2005

Secondo semestre

Tra le 7-9 domande sui contenuti del modulo sono inserite nella prova scritta-orale del corso di Proteomica e Metabolomica. Le domande sono a quiz con 4-5 possibili risposte di cui una sola è esatta. Tra le domande ve ne è sempre una aperta ed alcune possono prevedere l’esecuzione di calcoli o di interpretazione di spettri di massa MS/MS di peptidi. La prova orale prevede la discussione della prova scritta/orale.



Ogni giorno previo appuntamento.

Esporta

The course will provide knowledge of proteomics technologies applied to clinical investigations.

The course will provide knowledge of proteomics applied to clinical investigations.

Introduction to the terminology and to the features of the chromatographic techniques used for quali-quantitative investigations. Knowledge of mass spectrometry applied to proteomics. Proteins identification using the “Peptide mass fingerprint” approach. Tandem mass spectrometry (MS/MS). Interpretation of MS/MS spectra of peptides. Bottom-up and top-down proteomics approaches used to identify proteins and peptides. Characterization of posttranslational modification by Mass Spectrometry. Quantitative proteomics: gel-based and gel-free; label-based and label-free. Mass Spectrometry-Imaging technology (profiling and imaging) and its applications. Examples of application in clinical researches.

Basic knowledge in the field of Chemistry, Biochemistry and Statistics

Lectures and practical lessons

Lectures / practical lessons  will take place in physical presence

Reviews e and scientific articles published on international journals will be provided during the course. Downard K., Mass spectrometry . A foundation course. Royal Society of Chemistry, 2004 ISBN 0-8504-609-7 Gary Siuzdak, Mass Spectrometry for Biotechnology, Academic Press 1996 Per consultazione: J. H. Gross, Mass Spectrometry. A Textbook, Berlin – Heidelberg, Springer Verlag, 2004 E. De Hoffmann, V. Stroobant, Mass Spectrometry. Principles and Application, 2nd Edition Chichester, John Wiley & Sons, 2001. C. Dass, Principles and Practice of Biological Mass Spectrometry, New York, Wiley-Interscience, 2000. ISBN 0471330531 Chapman, John R. Mass Spectrometry of Proteins and Peptides, Humana press 2000, ISBN 0- 89603-609-X Walker, John M. The Proteomics Protocols Handbook Humana Press, 2005

Second semester

Among the 7-9 questions on the contents of the module are included in the written-oral test of the course of Proteomics and Metabolomics. The questions are quiz with 4-5 possible answers of which only one is correct. Among them, there is always an open one and some that may require the execution of calculations or interpretation of mass spectrums (MS / MS) of peptides. The oral examination will be done based on the written/orals questions.


Every day upon appointment

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Scheda del corso

Settore disciplinare
BIO/10
CFU
5
Periodo
Secondo Semestre
Tipo di attività
Obbligatorio
Ore
44
Lingua
Italiano

Staff

    Docente

  • FM
    Fulvio Magni

Metodi di iscrizione

Iscrizione manuale
Iscrizione spontanea (Studente)