Syllabus del corso
Obiettivi
Il corso si prefigge di fornire allo studente gli strumenti necessari per la corretta richiesta delle indagini microbiologiche e per l’interpretazione critica dei risultati, sia come probabilità di malattia che di gravità e del significato fisiopatologico, clinico e prognostico.
Contenuti sintetici
Accertamenti diagnostici relativi alle infezioni respiratorie, del sistema nervoso centrale, dell’apparato gastroenterico, dell’apparato genito-urinario, procreazione medico assistita. Infezioni in gravidanza, del feto, del neonato, dell’infanzia e dell'adoloscenza; infezioni sistemiche, cardiache, delle ossa, delle articolazioni e della cute, infezioni opportuniste e correlate all'assistenza. Metodologie e tecniche diagnostiche dirette ed indirette nella batteriologia, virologia, micologia e parassitologia. Valutazione della sensibilità in vitro dei microorganismi ai farmaci antimicrobici. Modalità di prelievo. Discussione di casi clinici.
Programma esteso
Ruolo del laboratorio di microbiologia.
Percorso diagnostico.
Diagnosi microbiologica diretta: diagnosi rapida, microscopia, terreni di coltura, identificazione dei microrganismi isolati - biochimica, tecnologia automatica, MALDI-TOF - sierologica, tecniche in biologia molecolare.
Saggi di sensibilità - agar diffusione, tecnologia automatica, determinazione delle MIC.
Diagnosi microbiologica indiretta: tecniche microscopiche, tecniche immunologiche, biologia molecolare. controllo di qualità in microbiologia, accuratezza delle procedure. interpretazione dell'antibiogramma e delle MIC, linee guida EUCAST.
Malattie infettive emergenti e riemergenti
Carte di flusso.
Discussione casi clinici.
Infezioni intravasali e cardiache
- Emocoltura: modalità di prelievo, diagnosi di laboratorio ed interpretazione dei risultati.
- Catetere venoso centrale: modalità di prelievo, diagnosi di laboratorio ed interpretazione dei risultati. biomarcatori di sepsi.
Infezioni delle alte vie respiratorie: modalità di prelievo, diagnosi di laboratorio ed interpretazione dei risultati. modalità di prelievo per diagnosi da infezione da coronavirus.
Infezioni delle basse vie respiratorie: modalità di prelievo, diagnosi di laboratorio ed interpretazione dei risultati.
Infezioni dell'apparato genito-urinario - infezioni sessualmente trasmissibili:
- Modalità di prelievo, diagnosi di laboratorio ed interpretazione dei risultati.
- Consulenza pre e post test di laboratorio per HIV e gestione dei pazienti HIV.
- Infezione delle vie urinarie: modalità di prelievo, diagnosi di laboratorio ed interpretazione dei risultati.
Infezioni dell'apparato gastroenterico: modalità di prelievo, diagnosi di laboratorio ed interpretazione dei risultati. Epatiti virali A, C, E, B, D, ed emergenti: interpretazione esami sierologici.
Procreazione medico assistita
- Generalità, modalità di prelievo.
- Apparato genitale femminile/ apparato urogenitale maschile
- Screening PMA donna/uomo, screening PMA TORCH coppia/donna.
Infezioni del feto, del neonato, dell’infanzia e dell’adolescenza: modalità di prelievo, diagnosi di laboratorio ed interpretazione dei risultati.
Infezioni del sistema nervoso centrale: modalità di prelievo, trasporto dei campioni, diagnosi di laboratorio ed interpretazione dei risultati.
Infezioni della cute e delle ossa piogeniche e micotiche, infezioni di protesi articolari e mezzi di osteosintesi:
- Modalità di prelievo, diagnosi di laboratorio ed interpretazione dei risultati.
Microbiologia dei liquidi sterili - amniosite, pericardite, peritonite, pleurite, artrite settica, borsite - Modalità di prelievo, diagnosi di laboratorio ed interpretazione dei risultati.
Infezioni correlate all'assistenza: cause, fattori e rischio di trasmissione, batteri e funghi pericolosi; raccomandazioni OMS.
Micobatteriosi: preanalitica e diagnosi microbiologica.
Interazione fra povertà, malnutrizione e infezioni.
Microrganismi isolati raramente responsabili di infezioni gravi.
Antropozoonosi parassitarie:
- Generalità, arbovirosi.
- Zoonosi; turalemia, leptospirosi, malattia di lyme: modalitàdi prelievo, diagnosi di laboratorio ed interpretazione dei risultati.
- Infezioni treamesse da vettori: malaria – modalità di prelievo, diagnosi di laboratorio ed interpretazione dei risultati.
Infezioni parassitarie dell'apparato gastroenterico. - Giardiosi: modalità di prelievo, diagnosi di laboratorio ed interpretazione dei risultati;
- Infezioni da parassiti elminti: teniosi, ossiuriasi, modalità di prelievo.
- Infezioni da amebe a vita libera: generalità e diagnostica di laboratorio.
Infezioni da artropodi: Pediculus spp., Sarcoptes scabie; diagnosi clinica e di laboratorio.
Tecnica di rimozione della zecca.
Prerequisiti
conoscenze acquisite duraante i corsi delle scienze di base
Modalità didattica
Tutte le lezioni sono svolte in presenza in modalità erogativa
- 12 lezioni da 2 ore svolte in modalità erogativa in presenza
Materiale didattico
McPherson RA, Pincus MR Henry's Clinical Diagnosis and Management by Laboratory Methods, 23a edizione in lingua inglese. Ed. Elsevier, 2016
Microbiologia Clinica (autori: Mims c., Dockrell HM., Goering RW., Roitt I., Wakelin D., Zuckerman M.) EMSI, 2006, III ed.
G. Antonelli, M. Clementi, G. Pozzi, G.M. Rossolini Principi di Microbiologia medica
Fabrizio Bruschi, Edoardo Pozio De Carneri Parassitologia generale e umana
Verrà inoltre distribuito materiale didattico durante le lezioni
Periodo di erogazione dell'insegnamento
Primo semestre
Modalità di verifica del profitto e valutazione
V.Syllabus di Medicina di Laboratorio
Orario di ricevimento
Su appuntamento richiesto via e-mail
sergio.frugoni@unimib.it
Sustainable Development Goals
Aims
The course aims to provide the student with the tools necessary for the correct request of microbiological investigations and for the critical interpretation of the results, both in terms of disease probability and severity and pathophysiological, clinical and prognostic significance.
Contents
Diagnostic tests relating to infections of the respiratory system, central nervous system, gastrointestinal system, genitourinary system, medically assisted procreation. Infections during pregnancy, of the fetus, of the newborn, of childhood and adolescence; systemic, cardiac, bone, joint and skin infections, opportunistic and healthcare-related infections. Direct and indirect diagnostic methodologies and techniques in bacteriology, virology, mycology and parasitology. Evaluation of the in vitro sensitivity of microorganisms to antimicrobial drugs. Withdrawal methods. Discussion of clinical cases.
Detailed program
Role of the microbiology laboratory.
Diagnostic path.
Direct microbiological diagnosis: rapid diagnosis, microscopy, culture media, identification of isolated microorganisms - biochemistry, automatic technology, MALDI-TOF - serological, techniques in molecular biology.
Sensitivity assays - agar diffusion, automatic technology, MIC determination.
Indirect microbiological diagnosis: microscopic techniques, immunological techniques, molecular biology. quality control in microbiology, accuracy of procedures. interpretation of the antibiogram and MICs, EUCAST guidelines.
Emerging and re-emerging infectious diseases
Flow cards.
Discussion of clinical cases.
Intravascular and cardiac infections
- Blood culture: sampling method, laboratory diagnosis and interpretation of results.
- Central venous catheter: sampling method, laboratory diagnosis and interpretation of results. sepsis biomarkers.
Upper respiratory tract infections: sampling methods, laboratory diagnosis and interpretation of results. sampling method for diagnosis of coronavirus infection.
Lower respiratory tract infections: sampling methods, laboratory diagnosis and interpretation of results.
Infections of the genitourinary system - sexually transmitted infections:
- Method of sampling, laboratory diagnosis and interpretation of results.
- Pre and post HIV laboratory test counseling and management of HIV patients.
- Urinary tract infection: sampling methods, laboratory diagnosis and interpretation of results.
Infections of the gastrointestinal tract: sampling methods, laboratory diagnosis and interpretation of the results. Viral hepatitis A, C, E, B, D, and emerging: interpretation of serological tests.
Medically assisted procreation
- General information, withdrawal methods.
- Female genital system/male urogenital system
- PMA screening for women/men, PMA TORCH screening for couples/women.
Infections of the fetus, newborn, childhood and adolescence: sampling methods, laboratory diagnosis and interpretation of the results.
Infections of the central nervous system: collection methods, transport of samples, laboratory diagnosis and interpretation of results.
Pyogenic and mycotic skin and bone infections, infections of joint prostheses and osteosynthetic devices:
- Method of sampling, laboratory diagnosis and interpretation of results.
Microbiology of sterile liquids - amnionitis, pericarditis, peritonitis, pleurisy, septic arthritis, bursitis - Method of sampling, laboratory diagnosis and interpretation of results.
Healthcare-related infections: causes, factors and risk of transmission, dangerous bacteria and fungi; WHO recommendations.
Mycobacteriosis: preanalytical and microbiological diagnosis.
Interaction between poverty, malnutrition and infections.
Isolated microorganisms rarely cause serious infections.
Parasitic anthropozoonoses:
- General information, arbovirosis.
- Zoonoses; turalemia, leptospirosis, Lyme disease: sampling methods, laboratory diagnosis and interpretation of results.
- Vector-borne infections: malaria – sampling methods, laboratory diagnosis and interpretation of results.
Parasitic infections of the gastrointestinal system. - Giardiosis: sampling methods, laboratory diagnosis and interpretation of results;
- Infections by helminth parasites: teniosis, oxyuriasis, sampling methods.
- Free-living amoeba infections: general information and laboratory diagnostics.
Arthropod infections: Pediculus spp., Sarcoptes scabie; clinical and laboratory diagnosis.
Tick removal technique.
Prerequisites
basic science knowledge
Teaching form
All lessons are held in person in delivery mode
- 12 lessons of 2 hours carried out in presence mode
Textbook and teaching resource
McPherson RA, Pincus MR Henry's Clinical Diagnosis and Management by Laboratory Methods, 23a edizione in lingua inglese. Ed. Elsevier, 2016
Microbiologia Clinica (autori: Mims c., Dockrell HM., Goering RW., Roitt I., Wakelin D., Zuckerman M.) EMSI, 2006, III ed.
G. Antonelli, M. Clementi, G. Pozzi, G.M. Rossolini Principi di Microbiologia medica
Fabrizio Bruschi, Edoardo Pozio De Carneri Parassitologia generale e umana
Didactic material will also be distributed during the lessons
Semester
First Semester
Assessment method
See Syllabus of Laboratory Medicine
Office hours
By appointment requested by e-mail
sergio.frugoni@unimib.it
