Course Syllabus
Programma esteso
Questo corso introduce i metodi statistici utilizzati per progettare e analizzare dati di laboratorio e biomedici, con particolare attenzione a come scegliere il test appropriato e utilizzarlo correttamente, senza entrare nel dettaglio della matematica sottostante.
Si parte dalla progettazione sperimentale: repliche biologiche e tecniche, pseudoreplicazione, randomizzazione, cecità sperimentale ed effetti di batch. Verranno quindi affrontati i principi dell’inferenza statistica (ipotesi nulla, p-value, intervalli di confidenza ed effect size), i concetti fondamentali della power analysis e del calcolo della numerosità campionaria, nonché le verifiche che guidano la scelta tra metodi parametrici e non parametrici (normalità, omogeneità delle varianze, trasformazione dei dati).
La parte centrale del corso sarà dedicata ai principali test statistici e alle condizioni in cui utilizzarli: confronto tra due gruppi (t-test, test di Welch, Mann-Whitney, test per dati appaiati), confronto tra più di due gruppi (ANOVA a una via, Kruskal-Wallis e test post-hoc), misure ripetute, disegni a due fattori e dati categoriali (test chi-quadrato e test esatto di Fisher).
Una lezione specifica sarà dedicata al problema dei confronti multipli e alle relative correzioni (Bonferroni, Holm, Benjamini-Hochberg FDR), includendone la rilevanza nell’analisi di dati omici.
Il corso si concluderà con le buone pratiche per la rappresentazione e la presentazione dei risultati (visualizzazione dei singoli dati, barre di errore, p-value esatti, effect size). Una sessione finale sarà dedicata a esercitazioni pratiche con GraphPad Prism su dataset simulati.
Modalità didattica
Lezione frontale
Materiale didattico
Materiale fornito dal docente
Sustainable Development Goals
Detailed program
This course introduces the statistical methods used to design and analyse laboratory and biomedical data, with a focus on how to choose the right test and use it correctly, without entering the underlying mathematics. We start from experimental design: biological versus technical replicates, pseudoreplication, randomisation, blinding and batch effects. We then cover the logic of statistical inference (null hypothesis, p-value, confidence intervals and effect size), the principles of power analysis and sample size calculation, and the checks that guide the choice between parametric and non-parametric methods (normality, variance homogeneity, data transformation). The core of the course is a guided tour of the main tests and when to use them: comparisons between two groups (t-test, Welch, Mann-Whitney, paired tests), more than two groups (one-way ANOVA, Kruskal-Wallis and post-hoc tests), repeated measures and two-factor designs and categorical data (chi-square, Fisher’s exact test). A dedicated session addresses the problem of multiple testing and its correction (Bonferroni, Holm, Benjamini-Hochberg FDR), including its relevance for omics data. We close with best practices for representing and reporting results (individual data points, error bars, exact p-values, effect sizes). A final session will conclude the course by hands-on exercises with GraphPad Prism on simulated datasets.
Teaching form
Lectures
Textbook and teaching resource
Course materials provided by the instructor