Insegnamento
Course full name
Introduction To Bioinformatics
Course ID number
2021-3-E3101Q116
Section outline
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- Definizioni. Array LCP. Passaggio da Suffix tree a suffix array e viceversa. Calcolo della sottostringa comune più lunga di 2 stringhe. (Gusfield 5, 5.1, 5.2, 5.3, 5.4, 7.4. dispensa)
- Pattern matching su suffix array. Algoritmo e implementazione (Gusfield 7.14)
- Ricerca della sottostringa comune più lunga di k stringhe: algoritmo e prima implementazione (Gusfield 7.4)
- Range minimum query. Implementazione sottostringa comune più lunga di k stringhe.