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  5. A.A. 2020-2021
  6. 3rd year
  1. Introduction To Bioinformatics
  2. General
  3. Python - Esercizio 1. Validatore del formato GTF
Insegnamento Course full name
Introduction To Bioinformatics
Course ID number
2021-3-E3101Q116
Course summary SYLLABUS

Python - Esercizio 1. Validatore del formato GTF

Completion requirements
Opened: Thursday, 5 November 2020, 12:00 AM
Due: Tuesday, 1 December 2020, 11:59 PM

Si richiede di scrivere un validatore del formato GTF (Gene Transfer Format) che prenda in input un file in formato GTF che annota un set di geni ed effettui la validazione del file rispetto alla specifica del formato.
Il validatore deve produrre in output un report con le violazioni presenti, specificando per ognuna di esse il record che la contiene (posizione all'interno del file in input) e tutte le informazioni che si ritengono necessarie per descriverla e correggerla.
Il validatore può essere prodotto sia come script che come Jupyter Notebook, e deve essere adeguatamente commentato. Si richiede inoltre un documento che elenchi e descriva brevemente le violazioni che sono state considerate. Per ogni violazione considerata, includere un file con tale violazione.
Il validatore deve essere caricato in un repository GitHub di cui va consegnato il link

Termine di consegna: 30 novembre.

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