Si richiede di scrivere un convertitore da FASTQ a FASTA che prenda in input un file di reads in formato FASTQ e produca in formato FASTA i soli reads che hanno le seguenti caratteristiche: (1) non sono più corti di una soglia L1 e non sono più lunghi di una soglia L2, (2) la qualità minima delle basi supera una soglia Q1, (3) contengono una sottoregione con qualità minima Q2 (maggiore di Q1) che è lunga almeno P% della lunghezza del read.
Viene richiesto l'uso di Biopython per leggere i reads dal file FASTQ in input e per stampare (in standard output o su file) i reads in formato FASTA.
L1, L2 (> L1), Q1, Q2 (> Q1) e P devono essere parametri in input.
Per ognuno dei reads in output, l'header FASTA deve contenere le seguenti informazioni: (1) identificatore, (2) lunghezza, (3) qualità minima delle basi, (4) start ed end della sottoregione con qualità minima Q2, (5) qualità media della sottoregione con qualità minima Q2
Il convertitore può essere prodotto sia come script che come Jupyter Notebook, deve essere adeguatamente commentato e deve essere caricato in un repository GitHub di cui va consegnato il link

Termine di consegna: 7 gennaio 2021.