Il PdE è organizzato secondo una logica di completamento della formazione universitaria. Con la riforma cosiddetta del 3+2 e con l'introduzione dei CFU, tutti i corsi di laurea hanno dovuto necessariamente ridurre l'ampiezza dei contenuti formativi erogati, adeguandoli al carico di studio richiesto allo "studente medio". Questo ha necessariamente cancellato argomenti non strettamente essenziali ma in ogni caso significativi e utili in un percorso di alta formazione. Il PdE propone una (parziale) reintegrazione di tali contenuti, rivolta agli studenti in grado di recepirli senza che questo interferisca negativamente con il profitto nel loro percorso di studio ordinario.

In breve, il PdE propone allo studente di scegliere due o più Syllabi di Eccellenza, eventualmente personalizzabili, che si concretizzeranno nella proposta di studio individuale di materiale didattico aggiuntivo. Il docente di riferimento incontrerà lo studente periodicamente per discutere quanto sarà stato autonomamente appreso e assistendo lo studente per quei contenuti che dovessero essere risultati non sufficientemente chiari o che richiedessero/stimolassero un approfondimento. Il carico didattico aggiuntivo è stimato tra le 100 e le 200 ore di studio.